癌癥的精準(zhǔn)醫(yī)療策略依靠發(fā)現(xiàn)促進(jìn)癌癥生長(zhǎng)的基因突變贱鼻,CRISPR基因編輯技術(shù)能夠快速和有效地產(chǎn)生基因敲除喻奥,調(diào)節(jié)內(nèi)源基因表達(dá)和復(fù)制與癌癥相關(guān)的基因組變化僵朗。由于CRISPR技術(shù)的簡(jiǎn)便和高效性赖欣,目前生成基因敲除小鼠模型已經(jīng)成為常規(guī)操作。而且验庙,通過(guò)將CRISPR基因編輯系統(tǒng)的所有組分選擇性地引入某些體細(xì)胞中顶吮,可以生成組織特異性的癌癥模型。比如粪薛,使用CRISPR在造血干細(xì)胞中編輯Tet2悴了,Runx1,Dnmt3a,Nf1和Smc3基因可以激發(fā)急性髓系白血病湃交。將CRISPR遞送到肝臟熟空、胰腺或肺部能夠迅速生成具有復(fù)雜表型的癌癥模型。
綜述作者指出搞莺,CRISPR技術(shù)對(duì)癌癥研究產(chǎn)生的最大影響可能是CRISPR篩選息罗。這種篩選使用靶向基因組中不同基因的向?qū)NA(gRNA)文庫(kù),可以系統(tǒng)性地敲除細(xì)胞系或類器官中的任何基因才沧,然后觀察基因敲除對(duì)癌細(xì)胞生長(zhǎng)或藥物反應(yīng)的影響迈喉。
CRISPR在癌癥研究方面的另一個(gè)重要應(yīng)用是追蹤癌細(xì)胞的譜系變化。癌癥的一大特征是它的異質(zhì)性温圆,癌細(xì)胞不斷積累基因變異挨摸,導(dǎo)致產(chǎn)生具有不同特征的細(xì)胞克隆。理解腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性并且追蹤新克隆的產(chǎn)生和演化讓科學(xué)家們更全面地了解腫瘤發(fā)生岁歉。
目前油坝,研究人員已經(jīng)開發(fā)出多種基于CRISPR的追蹤策略,能夠在包含多種細(xì)胞克隆的混合細(xì)胞群體中刨裆,發(fā)現(xiàn)不同的細(xì)胞克隆澈圈,并且追蹤它們隨著時(shí)間推移的動(dòng)態(tài)變化。CRISPR技術(shù)可以在細(xì)胞中引入獨(dú)特的條形碼帆啃,它們可用來(lái)標(biāo)記癌細(xì)胞譜系瞬女。而最新的CRISPR記錄系統(tǒng)能夠在特定時(shí)間在基因組中引入標(biāo)記,通過(guò)分析這些不同的標(biāo)記努潘,可以構(gòu)建不同癌細(xì)胞克隆之間的譜系關(guān)系诽偷。
盡早發(fā)現(xiàn)癌癥給治愈癌癥提供最好的機(jī)會(huì)疯坤,CRISPR技術(shù)可以幫助開發(fā)出更為靈敏的分子診斷工具报慕,輔助癌癥的早期檢測(cè)。基于Cas12和Cas13的CRISPR分子診斷系統(tǒng)已經(jīng)被用于從患者腫瘤組織活檢中發(fā)現(xiàn)與癌癥相關(guān)的基因突變压怠。它們?cè)诎l(fā)現(xiàn)特定致癌基因突變序列后可以通過(guò)切割攜帶熒光報(bào)告蛋白的RNA序列眠冈,發(fā)出熒光信號(hào)。這一技術(shù)在新冠大流行期間被用于生產(chǎn)快速靈敏的新冠病毒檢測(cè)菌瘫。同樣的平臺(tái)可用于生成高度靈敏的個(gè)體化癌癥發(fā)現(xiàn)和監(jiān)控系統(tǒng)蜗顽。
此外,CRISPR系統(tǒng)可用于在基因組的特定區(qū)域精準(zhǔn)切下DNA片段雨让,與傳統(tǒng)的隨機(jī)基因組片段化(fragmentation)手段相比雇盖,這種方式可以富集感興趣的DNA片段,與下一代基因測(cè)序相結(jié)合栖忠,可以在樣本量非常少的情況下崔挖,發(fā)現(xiàn)特定基因上的基因突變贸街。這一技術(shù)目前正在臨床試驗(yàn)中接受評(píng)估,用于發(fā)現(xiàn)卵巢癌中的p53突變狸相。
在癌癥治療方面,CRISPR技術(shù)的主要應(yīng)用之一是工程化改造免疫細(xì)胞卷哩,生成抗癌免疫療法蛋辈。多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)顯示,使用CRISPR基因編輯靶向敲除T細(xì)胞的PD-1表達(dá)可以提高T細(xì)胞的抗癌活性将谊。這類候選療法已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段冷溶。
此外,在生產(chǎn)同種異體的“通用型”CAR-T細(xì)胞療法時(shí)尊浓,CRISPR基因編輯可以用于敲除內(nèi)源性T細(xì)胞受體和來(lái)自健康供體的T細(xì)胞表面的人類白細(xì)胞抗原(HLA)逞频,從而降低異體細(xì)胞輸入帶來(lái)的免疫排斥和移植物抗宿主病風(fēng)險(xiǎn)。
而且栋齿,使用CRISPR/Cas9技術(shù)還可以將表達(dá)CAR的序列特異性地插入到細(xì)胞的T細(xì)胞受體α恒定區(qū)(TRAC)的基因位點(diǎn)苗胀,帶來(lái)CAR的一致性表達(dá)。在體外和小鼠模型中瓦堵,這種方法生成的CAR-T細(xì)胞與常規(guī)CAR-T細(xì)胞相比基协,表現(xiàn)出增強(qiáng)的抗癌活性。
在體外改造T細(xì)胞療法之外菇用,使用CRISPR基因編輯直接靶向驅(qū)動(dòng)癌癥的基因變異是一個(gè)吸引人澜驮,同時(shí)也非常困難的挑戰(zhàn)。理論上惋鸥,通過(guò)CRISPR基因編輯直接糾正驅(qū)動(dòng)癌癥的基因變異杂穷,或者殺死產(chǎn)生特定基因變異的癌細(xì)胞,可以達(dá)到抑制腫瘤生長(zhǎng)的效果卦绣。然而耐量,這一策略需要克服多重障礙,包括完成腫瘤特異性療法遞送滤港,以及需要達(dá)到高效率的基因編輯廊蜒。
目前的臨床前研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些腫瘤特異性基因編輯的策略。比如蜗搔,靶向致癌基因融合的CRISPR基因編輯系統(tǒng)可以在選擇性靶向腫瘤細(xì)胞的同時(shí)劲藐,擾亂促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)的基因變異八堡。另一項(xiàng)臨床前研究讓CRISPR-Cas13a系統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄受到NF-κB轉(zhuǎn)錄因子的控制樟凄,由于NF-κB在多種癌癥中被過(guò)度激活,這一策略可以在癌細(xì)胞中特異性表達(dá)CRISPR-Cas13a系統(tǒng)兄渺,敲低致癌基因的表達(dá)缝龄,達(dá)到抑制癌細(xì)胞生長(zhǎng)的效果。
在遞送技術(shù)方面叔壤,脂質(zhì)納米顆粒(LNP)在遞送新冠mRNA病毒方面已經(jīng)獲得巨大的成功瞎饲。利用LNP遞送編碼Cas9的mRNA和gRNA在概念驗(yàn)證研究中已經(jīng)有效靶向有絲分裂必需的基因PLK1,在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的小鼠模型中達(dá)到70%的體內(nèi)基因編輯效率炼绘,造成細(xì)胞凋亡并且抑制腫瘤生長(zhǎng)50%嗅战,改善生存期30%。在LNP表面偶聯(lián)靶向腫瘤特異性抗原的抗體也成功驅(qū)動(dòng)分散的腫瘤選擇性吸取LNP俺亮,提高腫瘤特異性編輯效率驮捍。
整體來(lái)看,這些臨床前研究顯示了體內(nèi)CRISPR基因編輯在治療癌癥方面的潛力脚曾,不過(guò)將CRISPR體內(nèi)基因編輯轉(zhuǎn)化為可行的臨床期抗癌療法仍然需要很多努力东且。
雖然CRISPR在癌癥生物學(xué)領(lǐng)域有廣泛的用途本讥,然而綜述作者指出珊泳,這一技術(shù)的進(jìn)一步開發(fā),特別是在臨床治療方面拷沸,仍然需要克服幾個(gè)局限性色查。Cas酶導(dǎo)致的DNA雙鏈斷裂可能引發(fā)無(wú)意的DNA片段丟失,在有些情況下可能驅(qū)動(dòng)染色體碎裂(chromothripsis)撞芍,從而影響正常細(xì)胞的功能综慎。CRISPR技術(shù)導(dǎo)致的DNA雙鏈斷裂損傷可能刺激p53信號(hào)通路,導(dǎo)致細(xì)胞死亡或者篩選p53功能下降的細(xì)胞勤庐。此外示惊,CRISPR系統(tǒng)的脫靶編輯可能性一直是研究人員關(guān)注的問(wèn)題。
不過(guò)愉镰,雖然這些潛在局限性是推動(dòng)CRISPR技術(shù)進(jìn)一步發(fā)展的重要局限米罚,目前科學(xué)家們已經(jīng)開發(fā)出工具來(lái)發(fā)現(xiàn)和最小化這些事件的發(fā)生。作者表示丈探,它們可能不會(huì)顯著阻礙CRISPR技術(shù)在臨床的應(yīng)用录择。未來(lái)的5-10年里,CRISPR技術(shù)將真正步入臨床期療法的階段碗降,在CAR-T療法和其它免疫細(xì)胞工程化方面的工作預(yù)示著它們將在治療癌癥方面有所作為隘竭。
在科學(xué)研究方面,CRISPR技術(shù)已經(jīng)開始解決癌癥的很多根本問(wèn)題讼渊,通過(guò)描述單個(gè)基因在癌癥細(xì)胞行為中的作用动看,它將為構(gòu)建下一代免疫療法、揭示非編碼區(qū)域和調(diào)控元件在腫瘤發(fā)生中的作用等多個(gè)領(lǐng)域賦能爪幻。CRISPR技術(shù)在過(guò)去和未來(lái)都將是我們理解和治療人類癌癥的關(guān)鍵工具之一菱皆。
參考文獻(xiàn):Alyna Katti et al. CRISPR in cancer biology and therapy [J].Nature reviews cancer. 2022 Feb 22:s41568-022-00441-w.